RNA甲基化是指在RNA分子上添加甲基化修饰的过程,通常是在RNA甲基转移酶的催化下将甲基供体中的甲基基团转移至RNA碱基的现象,一般发生在RNA转录后,是一种重要的表观遗传学调控机制,可以影响RNA的稳定性、成熟、转运、翻译和其他功能。
最早发现的RNA甲基化是m6A甲基化,即发生在腺苷酸(A)N6处的m6A甲基化(N6-甲基腺苷)修饰,也是目前为止发现的真核生物中最丰富RNA修饰,此外,其他常见的RNA甲基化修饰还有m5C、m7G、m1A、m6Am等。RNA甲基化可以发生在多种类型的RNA中,除了熟知的mRNA,还包括tRNA、rRNA、snRNA、snoRNA、miRNA和病毒RNA等其他RNA。
该平台实现了多种RNA甲基化修饰的检测,具体检测指标如下:
名称 |
简写 |
N6-methyladenosine |
m6A |
5-methylcytidine |
m5C |
2’-O-methyladenosine |
Am |
N1-methyladenosine |
m1A |
N6,N6-dimethyladenosine |
m6,6A |
2’-O-methylguanosine |
Gm |
1-methylguanosine |
m1G |
N2-methylguanosine |
m2G |
N7-methylguanosine |
m7G |
N2,N2-dimethylguanosine |
m2,2G |
N2,N2,7-trimethylguanosine |
m2,2,7G |
2’-O-methylcytidine |
Cm |
N3-methylcytidine |
m3C |
5,2’-O-dimethylcytidine |
m5Cm |
2’-O-methyluridine |
Um |
3-methyluridine |
m3U |
5-methyluridine |
m5U |
5,2’-O-dimethyluridine |
m5Um |
2’-O-methylinosine |
Im |
…… |
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