在哺乳动物的DNA中,5- 甲基胞嘧啶(5-mdC)参与许多生物学过程,是一种重要的表观遗传学修饰。最新的研究表明,5-甲基胞嘧啶(5-mdC)可以被TET蛋白连续氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hmdC)、5-醛基胞嘧啶(5-fodC)和5-羧基胞嘧啶(5- dC)。产生的5-醛基胞嘧啶和5-羧基胞嘧啶可以经由TDG介导的BER修复途径去除并恢复为未修饰的胞嘧啶,因此哺乳动物DNA的主动去甲基化过程可以通过TET蛋白连续地氧化5-甲基胞嘧啶来实现。许多研究表明DNA主动去甲基化与生物体生长发育以及各种生物学过程的调控紧密相关。
哺乳动物DNA去甲基化途径
植物和酵母与哺乳动物一样属于真核生物,其DNA中也可能存在上述修饰胞嘧啶。之前有文章报道植物基因组中存在5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。
该平台的建立实现了包括5-mdC、6mA、5-hmdC、5-fodC、5-cadC在内的多种DNA修饰 检测。
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